Contrairement au diocèse de Grenoble, les diocèses de Lyon et l’ancien diocèse de Vienne refusaient l’usage de l’orgue dans les églises. Avant la Révolution des orgues existaient dans les abbayes et les couvents mais peu d’instruments sont parvenus jusqu’à nous.
L’instrument le plus ancien de la ville de Vienne est celui de la cathédrale St Maurice, construit en 1841. L’orgue de St André le Bas date de 1860.
Le 5 août 1912, la paroisse de Saint André le Bas s’adresse aux établissements Merklin et Kuhn de Lyon pour acquérir un orgue. Le facteur propose l’ancien orgue de l’église St Nicolas de Givors - orgue construit par Joseph Merklin vers 1860 et qui vient d’être remplacé. La transaction est acceptée pour la somme de 10 500 francs par le curé Rival. L’instrument est installé au fond du chœur dans le courant de l’été 1913.
En 1954, l’orgue est transporté sur la tribune, sur le côté gauche pour ne pas masquer le vitrail.
